Lammps

Lammps - это пакет для классической молекулярной динамики. Lammps может применяться для крупных расчётов (до десятков миллионов атомов). В LAMMPS реализована поддержка большинства двухчастичных и многочастичных короткодействующих потенциалов.

Реализованы методы Эвальда и PPPM (Particle-particle particle-mesh) для расчетов сил в системах с кулоновским взаимодействием. Кроме МД, LAMMPS может применяться для проведения расчетов мезоскопических систем и коллоидных растворов. Для этого реализованы методы перидинамики, DPD (диссипативная динамика частиц), SRD (стохастическая вращательная динамика).

Есть возможность записи атомных конфигураций в текстовый или бинарный файл. Начальная конфигурация атомов для расчета может быть как сгенерирована в программе, так и прочитана из бинарного/текстового файла.